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2、中通量——高分辨率熔解法(HRM)检测DNA甲基化
HRM是一种最新的遗传学分析手段,具有很高的特异性、稳定性和重复性。
HRM目前的热点应用集中在
实验流程
针对某一段感兴趣基因上可能的甲基化位点,或还不确切知道其位点的实验,在电泳之后对条带进行克隆测序,从而得到想要的部分片段的测序结果,通过软件分析可以知道该片段甲基化发生的确切位点,测序克隆也可以计算其发生甲基化的频率。
4、技术特点
| Illumina | HRM | BSP |
样品 | 新鲜组织、血液、细胞,石蜡样本等生物材料 | ||
DNA用量 | 500ng甲基化后的DNA | 2ug未甲基化的DNA | 2ug未甲基化的DNA |
通量 | 1-12个样品/slide;每个样品可检测27k和450k个位点 | 1-96-384个样品;每个样品可检测几个位点 | 低通量,位点数少,是甲基化的金标准。 |
数据处理 | 探针注释、相关性分析、热图、与基因表达谱联合分析以及染色体搜索 | 特异熔解曲线 | 测序报告 |
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