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circRNA实时定量PCR检测是高通量筛选后验证的必选实验,基于qPCR检测技术的circRNA表达与差异分析是对测序、芯片结果的有效补充和验证。根据circRNA的闭合环形结构,针对其接头序列设计Divergent primers,能有效与线性RNA区分开来。引物经过多方面严格的验证,包括qPCR的扩增曲线、溶解曲线、产物的琼脂糖凝胶验证、产物的测序验证,可有效保障检测数据的准确性和可靠性,可检测细胞、组织、血液和外泌体等多种样本中circRNA差异表达情况。
图1 circRNA qPCR引物设计原理
图2 circRNA qPCR引物扩增曲线、溶解曲线
图3 circRNA qPCR产物琼脂糖凝胶电泳
图4 circRNA qPCR产物测序结果
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